В озерах Селигера водится большое количество рыб различных видов. В каждой местности и речушке обитают свои виды, и поэтому лучше заранее ознакомится, что и где ловится.
Лещ — самая главная промысловая рыба на Селигере. В мае и июне, во время нереста, лещ держится на мели и ловить его в это время легче всего. После нереста лещ уходит в середину озера и ловить «спортивными» методами его становится намного труднее.
Окунь — самая распространенная рыба Селигера, обитает практически везде. Селигерские окуни достигают размеров до 1,5 кг и поймать такую особь не такая уж и простая задача.
Щуки Селигера ничем не отличаются от щук в других местах России. Они так же любят заросли и мели и редко выходят на глубину, поэтому чаще всего щуки водятся в реках вокруг Селигера, особенно часто в Непри и Полоновке. Так же эта рыба часто встречается в Кравотынском, Троицком и Селижаровском плесах.
Судак — самая пожалуй ценная рыба Селигера. Имеет большие размеры, до 8кг весом, правде средний судак весит всего в районе килограмма и длинной до 40см. Но если поймать большую рыбу, то это будет настоящее достижение для любого рыбака. Но вот живет судак не по всему озеру, основные места его распространения Осташковский и Кравотынский плес.
Налим. Это холоднокровная рыба, и летом его поймать практически невозможно, но вот для любителей зимней рыбалки на Селигере это одна из самых главных целей. Но так же налим отлично ловится и весной, и осенью, все зависит от температуры воды.
В Селигере так же водятся: язь, плотва, красноперка, ряпушка, снеток, карась, уклейка, язь, голавль, сом, сиг, чехонь, елец, линь и другие.